In den letzten zwanzig Jahren haben François Buscot und sein Team den Einfluss von Landnutzung, globalen Wandel und Klimaänderung auf die Vielfalt und Funktionen von Bodenmikroorganismen mit einer breiten Palette von Methoden und Beobachtung oder experimentellen Ansätzen in interdisziplinären Projekten in Europa und Asien erforscht. Daraus sind knapp 300 wissenschaftliche Artikel oder Buchbeiträge entstanden. Seine Expertise setzte Buscot in Gutachtergremien für die Deutsche Forschungsgemeinschaft, die Alexander von Humboldt Stiftung oder die EU Kommission regelmässig ein. Mit drei Kollegen war er Gründungsdirektor des Deutschen Zentrums für integrative Biodiversitätsforschung (iDiv), Halle-Jena-Leipzig in 2012. Seit Herbst 2022 ist er emeritiert.